護國寺坐北朝南，依山布局，總占地面積達3500平方米。整個寺院的主體建築由大山門、天王殿、大雄寶殿、藥師佛殿、觀音殿、祖師殿藏經樓以及僧房前後院組成。大雄寶殿和藥師佛殿分別為歇山式建築和單檐懸山式建築，殿宇宏敞，結構精巧。 

    護國寺在唐宋時期是馳名巴蜀的“石佛道場”，曾與龍游寺、淨果寺、方溪寺並稱為合州的四大名剎。在護國寺殿堂內原有的50余尊佛教造像，均為造型生動的石刻圓雕，高大精美，各具特色。可惜的是，這些令人贊歎的石刻藝術珍品在二十世紀六十年代遭到了嚴重破壞。本次石刻藝術陳列即以護國寺過去的漢傳佛教寺廟造像布局、唐宋佛教造像風格、佛說造像經典和傳統造像工藝流程設計布展。

    釣魚城護國寺得名於佛教的護國思想。《金光明經》，《妙法蓮華經》，《仁王護國經》被稱為佛教護國三經，經中闡發了佛教徒要愛護自己的國家，報答國恩，成為佛教徒重要的愛國思想根源。佛教作為中華傳統文化的重要組成部分，在傳入中國兩千年的歷史中，與中國固有的文化相互吸收和融合，形成內容豐富的護國思想與實踐，在中外文化交流、民族融合與團結、社會安定與和諧等方面作出了巨大貢獻。

 

    中國唐代著名的護國寺就有廣東潮陽市護國寺、浙江溫州市護國寺等。歷史上，釣魚城護國寺最為興盛的時期是在南宋。南宋紹興二十五年(1155年)，思南宣慰田少卿捐資擴建護國寺，“建堂殿廊庑百有余間”。元代大德二年（1298年)，護國寺遇兵燹，明代孝宗弘治七年（1494年）合州知州金棋在原址上重建了護國寺，但在明清之交，寺廟再次毀於戰火之中。清代雍正五年（1727年)，合州士紳捐資再度重修了護國寺，隨後又經過嘉慶六年（1801年）住持智慧和尚對寺宇的擴建和石刻造像的募修，道光十年（1830年)住持僧勝叢歷經四年培修與添補。現在的護國寺，即為2005年9月搶救性落架維修後的建築群。

    如今護國寺已經改建為釣魚城博物館。該館以釣魚城36年抗戰史為主線，以圖文並茂的形式，從“歷史風雲、獨釣中原、鏖戰魚城、上帝折鞭、忠義千秋以及宋代兵器、宋代居民生活場景和名人字畫”等八個方面進行了展示，並有以油畫為背景的戰爭沙盤、12位宋蒙攻守雙方的歷史人物雕塑及汪德臣喊降中雷石、蒙哥中炮的戰爭場景。