藕園位於蘇州城東北部小新橋巷。正宅居中,有東、西兩個花園,故稱藕園；兩人耕種稱為“耦”,其園含寓含“夫婦歸田隱居”之意,以獨特的造園設計,向人們展示了奇妙的東方式的“羅曼蒂克”。傳統的中國園林的造園立意,往往是追求奇構妙築,供人觀景怡悅,而藕園去以夫妻恩愛的“羅曼蒂克”為造園立意,可謂生面別開。藕園東臨護城河,傍水而築,又地處幽深小巷,環境優美寧靜。園不甚廣,占地面積約11畝。園內建築布局獨特,正宅、大廳居中,左右兩側辟有對稱的東、西兩花園,在蘇州園林中別具一格。耦園的東花園,原為清初保寧太守陸錦所築,名“涉園”；到光緒初,園為退官後來蘇隱居養老的安徽巡撫、署兩江總督沈秉成所購得,沈聘請畫家顧潭設計建造,在整築涉園舊址的基礎上增建西花園,並改名“耦園”。耦園雖小,但以黃石假山著稱,宅園緊密結合,園內假山奇麗自然,幽谷深澗,愛月池中夾其間,園內花木蔥郁,有置身於“城市山林”之趣。 

     東園面積約四畝,以山為主,以池為輔,重點突出,配搭得當。主體建築坐北朝南,為一組重檐樓廳。這在蘇州園林中較為少見。其東南角有小院三處,重樓復道,總稱“城曲草堂”。西園面積更小,以書齋及織老屋為中心,前有月台,寬敞明亮,後有小院,幽雅清秀,隔山石樹木又建書樓一座；其南亦有一院,為不規則形狀,西南角設假山,設置花木,間置湖石,顯得幽曲有趣。 

     全園主景黃石假山,築於城曲草堂樓廳之前,石塊大小相間,手法逼真自然。假山東半部較大,自廳前石徑可通山上東側的平台及西側的石室；平台之東,山勢增高,轉為絕壁,直削而下,臨於水池,絕壁東南設磴道,依勢下至池邊,此處氣勢為全山最精彩處,假山西半部較小,自東而西逐級降低,坡度漸緩,止於小廳右壁。東西兩半部之間有谷道,兩側削壁如懸崖。而絕壁東臨水池,假山體量與池面寬度配合適當,空間相稱。山上不建亭閣,而於山頂山後鋪土之處,散置十余種花木,隨風搖曳,平添了山林趣味。而池水隨假山向南伸展,曲橋架於水上,池南端有閣跨水而築,稱“山水閣”,隔山與城曲草堂相對,形成以山為主體的優美景區。 

     耦園的正宅,像蘇州的古老宅第一樣,是一座四進三門樓的古宅院,有門廳、主廳、正廳,前三進為三開間的廳堂和庭院,第四進是五開間的高敞大廳,上下兩層,五樓五底,兩旁為廂房,是園主人的正宅。入園門是一個大院落,院東一帶花牆,院北為一月洞門。進門後,沿著起伏曲折的走廊向東、北行進,即為“城曲草堂”,寓意他們夫妻厭惡官場奢侈豪華的生活,而甘居於草堂白屋的隱居生活。堂二層,中間設大廳三間,為昔日園主宴客的地方,體形寵大,裝修精美。堂北有小院三處,堂南有平台。堂的東、西兩邊有廊,名曰“樨廊”和“筠廊”。 

     西園以書齋為主,前有平台、湖石假山,東有鶴壽亭,北有藏書樓。書齋取名“幟簾老屋”,面闊三間,四周有象征群山懷抱的疊石和假山,假山純樸自然,輪廓完整,山上有雲牆相隔,山下有山洞相通,與書齋前寬暢的平台、四時花艷的花壇組成一組幽靜恬美的環境。這組設計,寓意夫妻雙雙在山林深處,一起讀書明志,一起繼承父志、幟簾勞動之意境。在書齋後面,建有一座不對稱的凹形書樓,園主沈秉成和其夫人嚴永華雅好詩文昆曲,在此閱覽、吟詩作畫,這對伉俪情深、才華橫溢的佳偶在蘇十年,隱居耦園八年,夫唱婦隨,在此留下了眾多的詩篇與丹青。嚴永華《過洞庭》詩雲：“煙雨滄茫接窅冥,君山橫掃黛螺青。城南老樹今何在？也學高吟過洞庭。”詩文格調清新。 

     東園名“涉園”,又稱“小郁林”,面積三畝余,以池為中心,東、西、北三面臨河,景色絕佳,有城曲草堂,雙照樓,樨廊,邃谷,受目池,宛紅槓,山水間,枕波軒,聽橹樓等十景。 

     入園門,一帶湖石假山擋住視線,可免園景一覽無余之弊,謂之障景。假山純樸、輪廓完整,山上有雲牆相隔,山下有山洞相通假山北面,用湖石構築花台,自然典雅,花台北,是書齋,面閻王間,名“織簾老屋”,四周有群山環抱的疊石和假山,象征夫妻雙雙在山林深處,一起讀書明志,一起繼承父業,雙雙織簾之意境。書齋前,有寬暢的月台,假山、花台成為書齋前一幅美好的畫面。書齋後有一院落,點綴峰石,栽植花木,其後為一不對稱的凹形書樓。 

     東花園在住宅東部。占地5.4畝,布局以山池為中心,南、東、北三面臨河,居城彎一隅。進洞門,向東,是一個曠朗的大院落,點綴湖石、花木和叢叢翠竹,景色清新自然。院東是一帶花牆,院北有洞門,門上置磚雕“藕園”額。因洞門內,是主景區。門內曲廊曲折,環圍貫通,沿廊酉行,是小客廳“枕波軒”。取《水經注》： 

     憑塘籍祖,高觀枕流。枕被與枕流同義,故名。 

     軒東窗,在外牆窗頂上,有磚刻“枕波雙隱”,窗側有磚刻對聯一付：藕園住佳藕,城曲築詩城。 

     聯意指出,此處負解臨流,宜於皆隱之意。由“枕波軒”北行,有小軒面北而立,是船廳,俗稱“旱船”。從船廳外望,花木山石,滿目蒼翠,異常恬靜優美。出船廳,經“棵廊”,棵即木棵,此處多植叢桂。故名。 

     到主建築群“城曲草堂”。取唐李賀詩：女牛渡天河,柳煙滿城曲。 

     女牛指織女牛郎,城曲即城彎,亦切雙隱。是坐北朝南的重據樓廳,重樓復道,曲廊環抱,東南角一間凸出。中間設大廳三間,是園主曼客處。體形龐大,中隔企口杉木板壁,裝飾精美。堂北辟小院三處,布局精巧。堂的東面是“絢廊”。紹指新竹,此處叢竹翠碧,故名。 

     登樓,東南名“雙照樓”,取王僧儒：道之所貴,空有兼忘。行之可貴,其假雙照。 

     照是明的意思,此處舊為書樓,合有隱居學道之意。是觀賞園內景色和園外古城牆遺址的最佳處。