相傳清皇族遠祖有兄弟六人居此，滿語“六個”為“寧古塔”，故稱其地為寧古塔貝勒，簡稱寧古塔。有新舊二城：舊城在今海林市舊街。據《盛京通志》第三十一卷載：“寧古塔舊城，在海蘭河（今海浪河）南岸有石城（內城），高丈余，周一裡，東西各一門。”經實測內城（即石城）為正方形，邊長171米，周長684米，外城邊牆周圍2．5公裡，四面各一門。康熙五年（1666年）遷建新城，即今寧安市區，稱寧古塔新城。清初寧古塔為設置在盛京（今沈陽）以北管轄黑龍江、烏蘇裡江廣大地區的軍事、政治和經濟中心。