為了紀念申遺成功，作為檔案收藏地和歷史見證地，侵華日軍南京大屠殺遇難同胞紀念館將在位於南京市水西門大街主入口的雕塑廣場中央為世遺修建標識碑，與現有的“全國文物重點保護單位——侵華日軍南京大屠殺遇難同胞叢葬地”標識碑並列。
　　該碑形制將仿照世界文化遺產明孝陵的世遺標識碑，材質暫定為花崗巖，顏色在白色、黑色與米色中擇其一。碑寬3.14米、高2.4米。標識碑將雙面雕刻同樣內容，右側為聯合國教科文組織和世界記憶工程的標志，碑文為“世界記憶遺產項目”、“南京大屠殺檔案”和“聯合國教科文組織”。據悉，該方案已由紀念館擴建工程總設計師、中國工程院院士何鏡堂組織論證。世遺標識碑將於今年12月13日國家公祭日前夕揭碑。屆時，前來參觀的觀眾在進入場館前，會首先看到標識碑。