南廓寺是以三座牌坊式的大門各為中軸線，組成東、中、西三個大院。中山門內有前後院，前院東、西看樓，後為鐘鼓樓，東西禅林院。現西仍為“禅林院”，東為杜少陵祠，祠內有杜甫及侍童塑像三尊。後院為三間兩進寬闊宏大的天王殿。院內有一株生長2300-2500年的三杈古柏，南向一枝黛色霜皮，干枯如柴，直插雲霄，但頂端仍青春煥發，枝葉茂盛。西北向一枝已枯。北向一枝巧架於槐樹枝杈上，更神奇的是已劈開的枯干中寄生著一株胸圍108公分的黑蛋樹（樸樹），與老樹相依為命，據考全國僅此一樹，觀者無不稱奇。

    東院觀音殿前有一八角攢尖頂亭，內有水井，清澈見底，水味甘美，四時不竭。相傳這就是杜甫詩中所指的“北流泉”。

    近年來，南廓寺又添兩景，一為清初詩人宋琬集二王及其他晉人法書所勒杜工部秦州雜詩石碑，一為新辟的“鄧寶珊將軍紀念亭”